由省级优秀教师、中科院专家及上市企业技术专家担纲主讲,系统介绍当前生命科学研究及资本追逐的热词—生物大数据,讲授其所蕴含的价值与挖掘利用技术。课程特色之一是内容新颖。本课程是应生物基因组测序技术的发展而创建,面向新一代测序技术所获得的生物大数据,国内外尚无同类课程上线,而一些大型公司更是将其作为高端收费类培训课程。课程特色之二是主讲教师结构合理。由高校教师、中科院研究人员和企业技术人员组成,强强联合、优势互补,使课程内容既具理论高度,又具实用价值。课程特色之三是兼具通识与专业。本课程涵盖通识类知识点和专业类知识点,通识类知识有助于大众学生了解生物大数据的特点、价值与应用,专业类知识帮助学生掌握生物大数据的分析技能。
第一章 绪论
第一节 大数据的特征与价值
第二节 生物学大数据基本概念
BBC纪录片 人类面对大数据
第一章测验
第二章 核酸数据库
第一节 DNA序列数据库
第二节 NCBI数据库检索策略
第二章测试
第三章 蛋白质数据库
第一节 蛋白质数据库概览
第二节 蛋白质序列数据库
第三节 蛋白质模式和域的数据库
第四节 蛋白质结构数据库
第五节 蛋白质分类数据库
第三章 课件
第三章测试题
第四章 基因组测序技术
第一节 基因组测序技术
第二节 基因组测序方式与质量控制
第三节 基因组测序的组装技术
第四节 转录组测序与分析
第五节 宏基因组测序与分析
第六节 基因组测序技术的应用:来自华大的案例
第五章 上机实操
第一节 RNA-Seq数据分析
第二节 基因组重测序数据分析