分子生物学实验是几代教师不断探索而搭建的集技能训练、创新能力、科研思维训练培养于一体的综合型实验课程。课程以问题为导向，以基因为主线，围绕分子生物学和基因工程中目的基因克隆及其应用和特定基因的表达分析为线索设计课程体系。实验项目包括教师讲解、实验操作、虚拟仿真三部分。讲解部分着重从实验设计和技术应用层面介绍实验背景，以及如何基于研究问题和研究目标设计实验，有助于学生理解实验内容，培养学生的科研思维能力；实验操作部分以微距近景的方式呈现完整的实验流程，使学生进一步理解实验设计，掌握操作细节；虚拟仿真项目让学生通过操作模拟的方式完成实验过程，掌握实验技术与方法，弥补实验类慕课无法让学生自主进行实验操作所导致的不足，辅助提升教学效果。
1 无菌操作技术与主要仪器设备的使用
1.1绪论（实验理论）
1.2实验耗材与试剂的准备与灭菌（实验操作）
1.3培养基的配制（实验操作）
1.4溶液的配制（实验操作）
1.5主要仪器设备的虚拟操作
延伸学习-分子生物学实验室安全与防护
延伸学习-实验室安全与防护学习材料
无菌操作技术与主要仪器设备的使用单元测验
2 琼脂糖凝胶电泳和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
2.1琼脂糖凝胶电泳（实验理论）
2.2琼脂糖凝胶电泳（实验操作）
2.3琼脂糖凝胶电泳（虚拟操作）
2.4SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳（实验理论）
2.5SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳（实验操作）
延伸学习
琼脂糖凝胶电泳和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳单元测验
3 目的基因AKP扩增及PCR产物的检测与回收
3.1 目的基因AKP扩增及PCR产物的检测与回收（实验理论）
3.2 PCR反应体系的准备与目的基因AKP扩增（实验操作）
3.3 扩增产物的琼脂糖电泳分离与检测（实验操作）
3.4 凝胶中PCR产物的回收（实验操作）
3.5 回收产物的检测与定量分析（实验操作）
延伸学习-AKP序列原始文献阅读及引物设计方法介绍
目的基因AKP及PCR产物的检测与回收单元测验
4 质粒DNA提取及电泳检测
4.1 质粒DNA提取及电泳检测（实验理论）
4.2 含质粒DNA的大肠杆菌细胞扩增（实验操作）
4.3 质粒DNA提取（实验操作）
4.4 琼脂糖凝胶电泳检测质粒DNA（实验操作）
延伸学习
质粒DNA提取及电泳检测单元测验
5 重组DNA的制备及大肠杆菌感受态细胞的转化
5.1 DNA重组-酶切连接（实验理论）
5.2 DNA重组-酶切连接（实验操作）
5.3 大肠杆菌感受态细胞的制备与转化（实验理论）
5.4 大肠杆菌感受态细胞的制备及转化（实验操作）
延伸学习
重组DNA的制备及大肠杆菌感受态细胞的转化单元测验
6 阳性重组子的筛选及外源基因的诱导表达
6.1 阳性重组子的筛选（实验理论）
6.2 阳性重组子的筛选（实验操作）
6.3 外源基因的诱导表达（实验理论）
6.4外源基因的诱导表达（实验操作）
延伸学习
阳性重组子的筛选及外源基因的诱导表达单元测验
7 外源基因表达产物的检测
7.1活性分析检测表达蛋白AKP（实验理论）
7.2活性分析检测表达蛋白AKP（实验操作）
7.3 Western blot（实验理论）
7.4 SDS-PAGE和Western blot法检测表达蛋白AKP（实验理论）
7.5 SDS-PAGE检测表达蛋白AKP（实验操作）
7.6 Western blot检测表达蛋白AKP（实验操作）
延伸学习
外源基因表达产物的检测单元测验
8 农杆菌介导的植物转基因技术
8.1 农杆菌介导的植物转基因技术（实验理论）
8.2 农杆菌介导的植物转基因技术（实验操作）
延伸学习
农杆菌介导的植物转基因技术单元测验
9 三亲接合法转化蓝藻
9.1 三亲接合法转化蓝藻（实验理论）
9.2 三亲接合法转化蓝藻（实验操作）
延伸学习
三亲接合法转化蓝藻单元测验
10 植物总RNA提取及RT-PCR
10.1 植物总RNA提取与电泳检测（实验理论）
10.2 植物总RNA提取（实验操作）
10.2 RT-PCR（实验操作）
植物总RNA提取及RT-PCR单元测验
11 实时荧光定量PCR方法检测小鼠脾细胞特定基因的表达
11.1 总RNA的提取与电泳检测（实验理论）
11.2 qRT-PCR法检测特定基因的表达（实验理论）
11.3 总RNA的提取与电泳检测（实验操作）
11.4 qRT-PCR法检测特定基因的表达（实验操作）
延伸学习-RT-PCR在检测新冠病毒方面的应用
实时荧光定量PCR方法检测小鼠脾细胞特定基因的表达单元测验
12 Southern杂交
11.1 基因组DNA的提取及电泳检测（实验理论）
11.2 Southern杂交（实验理论）
11.3 基因组DNA的提取及电泳检测（实验操作）
11.4 Southern杂交（实验操作）
延伸学习
Southern杂交单元测验
13 序列比对与BLAST实验
序列比对与BLAST实验（实验理论）
序列比对与BLAST实验（实验操作）
延伸学习
序列比对与BLAST实验单元测验
14 利用微量热泳动技术测定蛋白质与多肽的相互作用
14.1 微量热泳动技术测定蛋白质与多肽的相互作用（实验理论）
14.2 微量热泳动技术测定蛋白质与多肽的相互作用（实验操作）
15 siRNA对外源荧光素酶基因的沉默作用
15.2siRNA对外源荧光素酶基因的沉默作用（实验操作）
15.1siRNA对外源荧光素酶基因的沉默作用（实验理论）